Am 2. Oktober 1990 24:00 Uhr endete die Existenz der Nationalen Volksarmee, deren Soldaten und Einrichtungen mit Wirkung vom 3. Oktober 1990 00:00 Uhr Teil der Bundeswehr wurden. Als Folge davon wurde das Kfz-Regiment 2 in der personellen Stärke verringert und führte vorübergehend wieder die Bezeichnung Kfz- Bataillon 2.
Am 12. März 1991 wurde das Kfz-Bataillon 2 von seinem letzten aus der NVA stammenden Komandeur – Oberstleutnant Knaak – an den aus dem Bereich Bundeswehr West stammenden Kommandeur Oberstleutnant Kaufmann übergeben.
